Model 4 hanglind time

Description of the model


This fourth model is a new variation. It still compute the mass-action on the numerator, but attempts to make the flux saturate with the part on the denominator with the part of \(1 + {...}\), where we use handling time and the whole biomass consumption of the predator. \[\begin{align} F_{ij}^{real} = \frac{F_{ij}^{theoretical}}{1+h_ij * \sum_{i=1} ^{i}{F_{j}^{theoretical}}} && F_{ij}^{theoretical} &= \alpha_{j} * B_i * \frac{B_j}{M_j} \\ \end{align}\]

où
- \(\alpha\) est un paramètre spécifique à un prédateur (mais le prédateur peut se retrouver dans plusieurs réseaux différents)
- \(B_i\) et \(M_i\) sont la biomasse et la bodymass d’une proie dans un réseau spéficique
- \(B_j\) et \(M_j\) sont la biomasse et la bodymass d’un prédateur spéficique. La biomasse du prédateur est la même dans un réseau, mais peut varier d’un réseau à l’autre, alors que son bodymass sera le même pour chacun des réseaux.

et h_ij est

\[\begin{align} h_ij = c \cdot (\frac{Mj}{Mi})^b \end{align}\]

Summary table

Summary table model 4_ht
mean se_mean sd 2.5% 25% 50% 75% 97.5% n_eff Rhat
a_pop -8.5252347 0.0031086 0.2456013 -9.0014451 -8.6923589 -8.5268515 -8.3589264 -8.0431257 6242.302 1.0002192
a_sd 2.6644203 0.0019350 0.1720993 2.3543984 2.5434374 2.6601536 2.7767168 3.0209435 7910.648 0.9998380
c -4.6622078 0.0027252 0.2095204 -5.0841274 -4.8036310 -4.6594012 -4.5162982 -4.2636687 5910.918 1.0000352
b -0.1127425 0.0003950 0.0331382 -0.1789097 -0.1350594 -0.1123698 -0.0903488 -0.0489547 7037.578 0.9999362
sigma 1.7824386 0.0003655 0.0339931 1.7177771 1.7592624 1.7820413 1.8047358 1.8498999 8651.296 1.0000239

Exploring parameters posterior distribution

Respective predator alphas

One-one plot of simulation against data